Der Flughafen Guanaja (spanisch Aeropuerto de Guanaja, IATA-Code: GJA, ICAO-Code: MHNJ) ist ein Verkehrsflughafen auf der honduranischen Insel Guanaja, die zum Departamento Islas de la Bahía gehört. Die Insel befindet sich in der Karibik, ungefähr 70 km (37,8 NM) nördlich der Küste des honduranischen Festlands und 12 km (6,48 NM) entfernt von der Nachbarinsel Roatán.