Die Liste der Flughäfen in Estland enthält die wichtigsten Flughäfen Estlands. Zu den fünf wichtigsten Flughäfen werden jeweils die Kenndaten IATA-Code, ICAO-Code, das Jahr der Eröffnung, Nutzung, die Anzahl und Art der Start- und Landebahnen und die Stadt, in der sich der Flughafen befindet, angegeben.